为促进中药材交易，提高知名度，打造“中华药都”形象。1985年9月9日，亳县（今亳州市）县委、县政府组织举办了第一届中药材交易会，全国27个省、市、自治区约1200名药商参会，成交额达1.2亿元。从1991年开始，中药材交易会内容更加丰富，逐步加入了学术、文化等活动内容，初步形成了亳州药博会经贸、文化、学术三大主要版块构架。
2006年经国务院批准，商务部致函安徽省人民政府，同意我省举办国际（亳州）中医药博览会，至此，我市每年9月9日同期举办国际（亳州）中医药博览会暨全国（亳州）中药材交易会，药博会两次被商务部纳入内贸领域引导支持展会。
2014年全国清理和规范庆典研讨会论坛活动工作领导小组发文明确亳州药博会为保留展会。2019年，亳州药博会进行市场化办会，充分引入社会力量参会办会，使得药博会作为亳州经贸合作第一平台作用日趋凸显。
如今，亳州药博会已成为海内外具有广泛影响力的融经贸、文化、学术为一体的综合性会展品牌之一，对弘扬中医药文化、促进中医药发展和推动国际中医药的交流合作起到重要作用。
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